Deze boeiende serie jeugdherinneringen vertelt over een onconventionele school in Tokio tijdens de Tweede Wereldoorlog, waar leren werd gecombineerd met plezier, vrijheid en liefde. De school had oude treinwagons als klaslokalen en werd geleid door een bijzondere man – de oprichter en directeur, Sōsaku Kobayashi – die de onafhankelijkheid van kinderen diep waardeerde en een groot voorstander was van de vrijheid van meningsuiting en activiteit.
De vijftienjarige Billie en haar broertje Nico wonen bij hun vader in een geïmproviseerd idyllisch bestaan. Maar telkens als Adam toegeeft aan de verleiding van de alcohol, maakt geborgenheid plaats voor een delirium van tranen en schuld. Hun excentrieke moeder is er lang vandoor en heeft een toxische relatie met Beaux. Als hun vader gedwongen in de rehab verdwijnt, nemen Billy en Nico de benen met hun nieuwe vriend Malik, op zoek naar zijn vader die in Florida zou wonen.
De ooit zo veelbelovende politieagente Young-nam wordt na een reeks incidenten overgeplaatst naar een slaperig stadje aan de kust. Op de eerste dag ontmoet ze de 14-jarige Dohee, een eenzaam en vreemd meisje dat mishandeld wordt door haar alcoholistische stiefvader. Om haar te beschermen neemt Young-nam het meisje in huis. Aanvankelijk gaat dat goed.
An Invisible Sign of My Own draait om een jonge vrouw die een kluizenaarsbestaan leidt. Wanneer zij een baan als wiskundelerares krijgt aangeboden, verandert haar leven. De jonge wiskundelerares gebruikt haar vak om haar studenten door hun persoonlijke crises heen te helpen.