I en hærget, fremtidig verden, hvor ganske få mennesker har overlevet en dødelig virus, har en nation af genetisk udviklede aber vokset sig stærke, stiftet familie og ligner den dominerende race. Aberne lever i fred anført af den vise chimpanse Caesar, der var den første af sin slags, og som forstår og respekterer menneskets natur. Men freden skal vise sig skrøbelig, da et oprør ulmer hos de desperate mennesker. Snart er dyr og mennesker på kanten af en krig, hvor begge sider kæmper for intet mindre end artens overlevelse.
Flere generationer efter Cæsars regeringstid lever aber – nu den dominerende art – harmonisk, mens mennesker er blevet reduceret til at leve i skyggerne. Mens en ny tyrannisk abeleder bygger sit imperium, foretager en ung abe en rystende rejse, der vil få ham til at stille spørgsmålstegn ved alt, hvad han ved om fortiden og til at træffe valg, der vil definere en fremtid for både aber og mennesker.